福建是我国乃至世界肝病和肝癌的主要高发区,在海峡西岸经济区建设事业蓬勃发展形势的鼓舞下,作为闽籍科学大家,吴孟超院士多次倡导和呼吁福建要建立肝胆医院和肝病研究机构。为此,他多次专程回闽与省市领导沟通、协调,表示愿意联合国内外著名院士专家对福建进行实质性帮扶,推动福建肝病和肝癌防治与研究事业的科学发展新跨越。
在省、市政府和各级主管部门高度重视和支持下,福州市人民政府、第二军医大学、福建医科大学优势互补、强强联合,高起点、高水平,突出特色定位共同建设福建医科大学孟超肝胆医院、福建省肝病科学研究中心、福建省联合创新重点实验室和福建吴孟超科技教育发展基金会,依托第二军医大学和福建医科大学的技术力量和学术资源,全方位推进、提升家乡肝病和肝癌的学科建设、技术体系建设和人才队伍建设,造福广大肝病患者。

2010年11月,吴孟超院士代表第二军医大学与福建医科大学校长陈元仲签署战略合作协议