几十年来，吴孟超为我省培养一批优秀肝胆外科专家和技术骨干，他们中的大部分成员已成为我省乃至我国肝胆外科领域的中坚力量。

2011年始，吴孟超团队25名院士专家依托福建医科大学招收肝病及相关专业博士、硕士研究生，每年为福建定向培养高层次专业技术人才30～40人，为福建省肝病和肝癌防治与研究事业的可持续发展提供了坚实的人才保障。

吴孟超还高度重视福建省基层医务工作者和中青年专业人才的培训，先后2次在福建举办全国肝病新观念、新进展学习班，邀请100多位国内外知名院士专家授课，累计培训基层医务人员和中青年专业技术人员2200人次。

2012年6月18日，吴孟超应邀作客福建医科大学“福医大讲堂”，他提出为医之道，最要紧的是一个“德”字，为医者要有仁爱之心、责任之心、同情之心。为医之道，要善于做人，要做一个善于团结人的人、善于思考的人、善于总结的人、善于服务的人；为医之道，要有远大的理想，以成才成家为目标，以“多听、多看、多做”达到“会做、会讲、会写”；为医之道，贵在不断创新，要以科学的态度，敢于超越前人，还要善于捕捉灵感，要艰苦创业、不断追求。吴孟超的精彩发言，让在场师生深受感动和启发。